건강분석가

"신약 개발 실패율 90%", 과학자라면 한 번쯤 들었을 이 수치는 우리가 얼마나 많은 시간과 비용을 '잘못된 표적'에 쏟고 있는지를 보여줍니다. 최근 유전학은 이 문제를 해결할 새로운 길을 제시하고 있습니다. 바로 Mendelian Randomization을 활용한 drug target MR, 즉 유전자 정보를 이용해 '약물 표적의 타당성'을 미리 검증하는 전략입니다. 이번 포스팅에서는 drug target MR이 기존의 MR과 어떤 점에서 다른지, 어떻게 적용할 수 있는지 소개해보겠습니다. 왜 '단백질'을 MR의 노드로 삼는가?MR은 유전변이를 '무작위 배정된 실험'처럼 활용해 인과관계를 추론하는 방법입니다. 기존에는 질병과 연관된 risk factor(혈압, 콜레스테롤 등)을 타겟으로 삼았지만, 최..

Omics 2025. 4. 12. 16:09

들어가며: MR 분석의 전성기, 그리고 그림자최근 수년간, Mendelian Randomization (MR) 분석은 유전체 데이터의 폭발적인 증가와 더불어 "쉽고 빠른" 인과추론 도구로 각광받아 왔다. 하지만, 누구나 버튼 몇 번만 클릭하면 분석이 가능한 이 시대에, MR의 신뢰도는 위기를 맞고 있다. Stephen Burgess 등 세계적인 MR 전문가들은 이 문제를 정면으로 다루며 왜 MR 분석이 무너질 수 있는지를 냉철하게 진단하고 그 해법을 제시하고자 하는 노력을 하고 있다. 이번 포스팅에서는 현재 MR 분야에서 빈번히 다루어지고 있는 간과해서는 안 되는 몇 가지 주요 이슈에 대하여 정리해보았다. MR 분석에서 자주 발생하는 다섯 가지 문제1. 부적절한 연구 질문MR은 인과관계를 탐색하는 강력한..

Omics 2025. 4. 12. 15:22

Single-cell RNA sequencing 이란?Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) 은 개별 세포 단위에서 전사체의 발현 양상을 정밀하게 분석할 수 있는 기술이다. scRNA-seq은 세포 이질성을 이해하는 데 있어 획기적인 전환점을 마련하기도 했다. 기존의 bulk RNA-seq이 수천에서 수백만 개의 세포를 모두 합쳐 분석했다면, scRNA-seq은 각 세포의 고유한 전사체 프로파일을 보존함으로써 세포 간의 다양성과 희귀 세포 집단을 탐지할 수 있게 한다. 실험적 분석 방법 개요1) 단일 세포 분리- 가장 먼저, 조직이나 세포 집단에서 개별 세포를 분리해야 한다. 일반적으로는 효소를 이용해서 조직을 단일 세포로 분해하고, 이후에 FACS (Fluorescence..

Omics 2025. 4. 12. 14:50

어디선가 마이크로바이옴 또는 장내미생물이라는 단어를 한 번쯤 들어본 적이 있을 것이다. 이번 포스팅에서는 장내미생물이 무엇인지 알아보고, 특히 인체에서의 대사 활동에 초점을 맞추어 식이와 약물의 대사 과정에서 어떤 역할을 하는지를 중점적으로 살펴보도록 하겠다. 장내미생물이란?장내미생물은 인간의 소화계통, 특히 대장에 서식하는 수많은 미생물의 총집합을 말한다. 이 미생물군에는 박테리아, 바이러스, 곰팡이 등 매우 다양한 종류가 포함되어 있으며, 우리의 건강에 중요한 역할을 한다.장내미생물은 소화와 영양분의 흡수를 돕고, 병원균에 대한 방어 작용을 수행한다. 또한, 면역 체계를 조절하고, 신경계와도 상호작용하는 것으로 잘 알려져 있다. 예를 들어, 일부 미생물은 필수 비타민의 합성에 관여하며, 이는 우리 몸..

보건학 2024. 10. 20. 15:42

오늘은 보건의료 빅데이터를 다루는 데 필수적으로 이해해야할 필요가 있는 데이터베이스와 대표적인 데이터베이스인 관계형 데이터베이스, 그리고 SQL에 대하여 알아보도록 하겠습니다. 데이터베이스란?오늘날과 같은 빅데이터 시대에 데이터베이스에 대한 개념의 올바른 정립은 필수적입니다. 데이터가 4차 산업혁명 시대의 중요하고 유용한 자원이라면, 데이터베이스는 데이터를 저장하고, 가공하고, 정제하고, 사용하기 위한 도구라고 생각해볼 수 있습니다. 즉, 데이터를 잘 활용하겠다는 목적을 달성하기 위한 유용한 도구이자 수단입니다. 관계형 데이터베이스와 비관계형 데이터베이스가장 흔하게 들어봄직한 데이터베이스로는 관계형 데이터베이스가 있습니다. 그러나 관계형 데이터베이스 외에도 다양한 데이터베이스가 존재합니다. 여러 종류의 ..

보건학 2024. 5. 6. 15:12

이번 포스팅에서는 주요 우울 장애(Major Depressive Disorder, MDD)의 역학, 진단, 관리 방법, 치료 방안, 그리고 이 질환과 관련된 생활의 질에 대해 자세히 탐구할 것입니다. 주요 우울 장애는 가장 흔한 정신 건강 장애 중 하나로, 과거에 비해 현대 사회에서 일상 생활 중에 더욱 흔히 접하는 질병입니다. 안 좋은 기분, 이전에 즐거웠던 활동에 대한 관심이나 즐거움의 감소, 불면증 및 피로감과 같은 증상이 특징적입니다. 질병 역학 MDD의 유병률은 여성에서 남성보다 거의 두 배 높으며, 이는 성별 간의 생물학적, 심리사회적, 환경적 차이 때문일 가능성이 큽니다. 평생 유병률은 연구 디자인에 따라 약 10%에서 30% 이상까지 다양하게 보고됩니다. 진단 MDD의 진단은 임상 면담을 ..

보건학 2024. 4. 10. 21:35

근육은 우리 몸을 움직이게 하는 필수 요소이지만, 때때로 외부 충격이나 과도한 스트레스로 인해 손상을 입을 수 있습니다. 트라우마성 근육 손상은 직접적인 충격(타박상이나 절개상)이나 간접적인 비접촉성 외상(긴장과 파열)에 의해 발생할 수 있는 근육 조직의 손상을 의미합니다. 이러한 손상은 기능적 결손을 초래할 수 있으며, 특히 운동 선수들 사이에서 흔히 발생합니다. 최근에는 운동 선수가 아닌 일반인들 사이에서도 근력 운동에 대한 문턱이 낮아지며 주변에서 근육 손상을 직간접적으로 경험할 가능성이 더욱 높아지고 있는 추세입니다. 손상 메커니즘 근육 손상은 미세 수준에서 근섬유의 소규모 손상으로부터 전체 근섬유의 괴사에 이르기까지 다양한 형태로 나타날 수 있습니다. 소규모 손상은 근핵을 통해 수리될 수 있지만..

보건학 2024. 4. 10. 21:19

이번 포스팅에서는 방광암에 대한 현대적 이해와 질병에 대한 접근 방식, 그리고 다양한 병인 경로에 대해서 다뤄보도록 하겠습니다. 방광암의 복잡한 병리학, 진단 방법, 관리 전략 및 미래 연구 방향에 대하여 살펴보겠습니다. 방광암은 여러 병인 경로와 분자적 하위 유형을 가지고 있으며, 이에 따라 개별 환자에게 최적화된 치료 접근 방식을 결정하는 데 있어 환자의 개별적 특성을 고려하는 것이 중요합니다. 다른 질병들에서와 같이, 방광암의 조기 발견은 환자의 예후에 긍정적인 영향을 미칩니다. 조기 발견과 적절한 관리 전략은 환자의 생존율과 삶의 질을 개선할 수 있습니다. 기전 방광염은 방광 벽 근육 침범 여부에 따라 비근육 침윤성 방광암(Non-muscle-invasive bladder cancer, NMIBC..

보건학 2024. 4. 10. 21:03