건강분석가

이번 포스팅에서는 일상 생활에서 가장 빈번하게 발생하는 질환 중 하나인 흉터(또는 상처)의 질병 정의, 메커니즘에 대해 알아보고, 관리 방안에 대해 살펴보도록 하겠습니다. 흉터/상처가 치유되는 원리 피부의 깊은 층으로의 손상은 병리학적 흉터 형성으로 이어질 수 있으며, 이 과정은 혈액 응고, 염증, 증식, 흉터 성숙 및 재구성의 순차적 단계를 포함합니다. 이 단계들은 다양한 세포, 세포 경로, 신호 분자, 그리고 그에 관련된 세포외 기질 성분들의 복잡한 상호 작용을 통해 이루어집니다. 흉터의 질병 역학 흉터는 피부의 외상이나 수술 후 남는 자연스러운 치유 과정의 결과입니다. 특히, 비대성 흉터는 원래 상처의 경계 내에서 붉고 가렵고 돌출된 형태로 나타나며, 수술 상처의 약 35%에서, 화상 상처의 경우 ..

보건학 2024. 3. 30. 15:57

이번 포스팅에서는 ADHD라는 용어로 잘 알려져 있는 주의력 결핍/과잉행동 장애(Attention-deficit/hyperactivity disorder, ADHD)에 대하여 알아보도록 하겠습니다. ADHD의 유전적 및 환경적 요인, 뇌 구조 및 기능의 변화, ADHD가 삶의 질에 미치는 영향, 유병률 및 공존 질환, 진단 기준 및 관리 접근법에 대해 살펴보겠습니다. ADHD는 주로 어린 시절에 시작되는 신경발달 장애로, 특징적인 증상으로는 주의력 결핍, 과잉 활동, 충동성이 있습니다. ADHD의 질병 역학 ADHD의 유병률은 학령기 아동의 약 5%로, 국가 간에 크게 변동하지 않습니다. 비백인 인구 집단에서 ADHD를 평가한 연구는 적으며, 대부분의 ADHD 진단은 어린 시절 또는 청소년기에 이루어집니..

보건학 2024. 3. 30. 15:42

이번 포스팅에서는 최근 세계적으로 주목 받고 있는 감염성 질환 중 하나인 다제내성 결핵에 대하여 알아보겠습니다. 다제내성 결핵(다제내성 폐결핵, Multidrug-resistant tuberculosis, MDR-TB)은 전 세계 여러 지역, 특히 동유럽, 러시아, 아시아 및 사하라 이남 아프리카에서 공중 보건 문제로 대두되고 있습니다. 다제내성 결핵은 약물에 민감한 결핵에 비해 진단이 더 어렵고, 사망률과 발병률이 높으며, 결핵 후 폐 손상 비율이 높다는 특징을 가지고 있습니다. 다제내성 결핵이란? 결핵(Mycobacterium tuberculosis)이란 박테리아에 의해서 발생하는 호흡기 질환입니다. 결핵의 약물 내성 메커니즘은 복잡하고 다요인적입니다. 새로운 내성은 임의적이고 우연한 기회의 유전자 ..

보건학 2024. 3. 30. 15:21

지난 두 개의 포스팅에 걸쳐서 Mendelian Randomzation의 기본 개념과, 가장 기본적인 형태의 분석들에 대해서 정리해봤다. 2024.03.12 - [Omics] - Mendelian Randomization 1 Mendelian Randomization 1 Mendelian Randomization (MR)은 유전학적 변이를 도구변수로 사용하여 노출(위험 요소)과 결과 사이의 인과 관계를 추론하는 연구 방법론이다. 특정 유전 변이가 특정 위험 요소에만 영향을 미치고, 그 zinomi.tistory.com 2024.03.17 - [Omics] - Mendelian Randomization 2 Mendelian Randomization 2 이번 포스팅에서는 앞서 Mendelian Randomi..

Omics 2024. 3. 22. 10:53

Mediation analysis는 통계적 방법 중 하나로, 독립변수와 종속변수 사이의 관계를 매개변수(또는 중재변수)를 통해 어떻게 설명할 수 있는지 탐구한다. 이 분석을 통해, 독립변수가 종속변수에 미치는 직접적인 영향 뿐 아니라 매개변수를 통한 간접적인 영향도 평가할 수 있다. 기본 개념 독립변수(X): 원인 또는 예측 변수 종속변수(Y): 결과 또는 반응 변수 매개변수(M): 독립변수와 종속변수 사이의 관계를 매개하는 변수 Mediation analysis의 주요 단계 효과의 분해: 분석의 첫 단계에서는 독립변수가 종속변수에 미치는 전체 효과를 분해하여 구분한다. 직접 효과(독립변수가 종속변수에 직접 미치는 효과)와 간접 효과(매개변수를 통한 효과)로 나눈다. 경로 분석: 다음으로, 각각의 경로에..

보건학 2024. 3. 17. 12:57

이번 포스팅에서는 앞서 Mendelian Randomization 1 포스팅에서 다뤘던 전반적인 내용에 대하여 좀 더 심화된 내용을 구체적인 코드와 함께 정리해보겠다. [ 참고: Mendelian Randomization 1 포스팅 링크 ] 2024.03.12 - [Omics] - Mendelian Randomization 1 Mendelian Randomization 1 Mendelian Randomization (MR)은 유전학적 변이를 도구변수로 사용하여 노출(위험 요소)과 결과 사이의 인과 관계를 추론하는 연구 방법론이다. 특정 유전 변이가 특정 위험 요소에만 영향을 미치고, 그 zinomi.tistory.com MR의 세 가지 가정 먼저 MR의 세 가지 가정을 다시 복습해보자면, 관련성(Rele..

Omics 2024. 3. 17. 12:32

Mendelian Randomization (MR)은 유전학적 변이를 도구변수로 사용하여 노출(위험 요소)과 결과 사이의 인과 관계를 추론하는 연구 방법론이다. 특정 유전 변이가 특정 위험 요소에만 영향을 미치고, 그 위험 요소가 특정 결과에 영향을 미친다는 가정 하에 인과 관계를 추론한다. 이 방법은 유전학에서 Mendel의 법칙을 기반으로 하며, 무작위 대조시험(Randomized Controlled Trials, RCT)에서의 무작위 배정 원리를 유전학적 맥락에서 적용한 것이라고 볼 수 있다. RCT의 랜덤 배정과 MR의 유사성 RCT에서는 참가자를 무작위로 두 그룹(치료 그룹과 대조 그룹)으로 배정하여 치료의 효과를 평가한다. 이러한 무작위 배정은 치료와 대조 그룹 간의 기존의 차이를 최소화하여 ..

Omics 2024. 3. 12. 14:46

건강 빅데이터를 다루다보면 변수(차원)의 개수가 매우 많아지는 상황을 마주하게 된다. 특히, 유전체 데이터의 경우, 분석시 각각 하나하나의 Single Nucleotide Polymorphism(SNP)마다 어떤 특정한 질병 또는 표현형과 연관되었는지를 통계적으로 검증하는 상황에 마주하고는 한다. 유전체 데이터뿐 아니라 전사체, 단백체, 대사체 등 대부분의 오믹스 데이터가 이러한 경우에 해당된다. 오믹스가 아니라 표현형 중에서도 다양한 표현형 요소들의 패턴을 분석하고자 할 때도 있다.  이런 경우에 활용할 수 있는 방법론이 바로 Clustering analysis(군집분석)와 Factor analysis(요인분석)이다. Clustering analysis먼저 Clustering analysis는 개인별로..

Omics 2024. 3. 11. 23:28