건강분석가

지난 두 개의 포스팅에 걸쳐서 Mendelian Randomzation의 기본 개념과, 가장 기본적인 형태의 분석들에 대해서 정리해봤다. 2024.03.12 - [Omics] - Mendelian Randomization 1 Mendelian Randomization 1 Mendelian Randomization (MR)은 유전학적 변이를 도구변수로 사용하여 노출(위험 요소)과 결과 사이의 인과 관계를 추론하는 연구 방법론이다. 특정 유전 변이가 특정 위험 요소에만 영향을 미치고, 그 zinomi.tistory.com 2024.03.17 - [Omics] - Mendelian Randomization 2 Mendelian Randomization 2 이번 포스팅에서는 앞서 Mendelian Randomi..

Omics 2024. 3. 22. 10:53

Mediation analysis는 통계적 방법 중 하나로, 독립변수와 종속변수 사이의 관계를 매개변수(또는 중재변수)를 통해 어떻게 설명할 수 있는지 탐구한다. 이 분석을 통해, 독립변수가 종속변수에 미치는 직접적인 영향 뿐 아니라 매개변수를 통한 간접적인 영향도 평가할 수 있다. 기본 개념 독립변수(X): 원인 또는 예측 변수 종속변수(Y): 결과 또는 반응 변수 매개변수(M): 독립변수와 종속변수 사이의 관계를 매개하는 변수 Mediation analysis의 주요 단계 효과의 분해: 분석의 첫 단계에서는 독립변수가 종속변수에 미치는 전체 효과를 분해하여 구분한다. 직접 효과(독립변수가 종속변수에 직접 미치는 효과)와 간접 효과(매개변수를 통한 효과)로 나눈다. 경로 분석: 다음으로, 각각의 경로에..

보건학 2024. 3. 17. 12:57

이번 포스팅에서는 앞서 Mendelian Randomization 1 포스팅에서 다뤘던 전반적인 내용에 대하여 좀 더 심화된 내용을 구체적인 코드와 함께 정리해보겠다. [ 참고: Mendelian Randomization 1 포스팅 링크 ] 2024.03.12 - [Omics] - Mendelian Randomization 1 Mendelian Randomization 1 Mendelian Randomization (MR)은 유전학적 변이를 도구변수로 사용하여 노출(위험 요소)과 결과 사이의 인과 관계를 추론하는 연구 방법론이다. 특정 유전 변이가 특정 위험 요소에만 영향을 미치고, 그 zinomi.tistory.com MR의 세 가지 가정 먼저 MR의 세 가지 가정을 다시 복습해보자면, 관련성(Rele..

Omics 2024. 3. 17. 12:32

Mendelian Randomization (MR)은 유전학적 변이를 도구변수로 사용하여 노출(위험 요소)과 결과 사이의 인과 관계를 추론하는 연구 방법론이다. 특정 유전 변이가 특정 위험 요소에만 영향을 미치고, 그 위험 요소가 특정 결과에 영향을 미친다는 가정 하에 인과 관계를 추론한다. 이 방법은 유전학에서 Mendel의 법칙을 기반으로 하며, 무작위 대조시험(Randomized Controlled Trials, RCT)에서의 무작위 배정 원리를 유전학적 맥락에서 적용한 것이라고 볼 수 있다. RCT의 랜덤 배정과 MR의 유사성 RCT에서는 참가자를 무작위로 두 그룹(치료 그룹과 대조 그룹)으로 배정하여 치료의 효과를 평가한다. 이러한 무작위 배정은 치료와 대조 그룹 간의 기존의 차이를 최소화하여 ..

Omics 2024. 3. 12. 14:46

건강 빅데이터를 다루다보면 변수(차원)의 개수가 매우 많아지는 상황을 마주하게 된다. 특히, 유전체 데이터의 경우, 분석시 각각 하나하나의 Single Nucleotide Polymorphism(SNP)마다 어떤 특정한 질병 또는 표현형과 연관되었는지를 통계적으로 검증하는 상황에 마주하고는 한다. 유전체 데이터뿐 아니라 전사체, 단백체, 대사체 등 대부분의 오믹스 데이터가 이러한 경우에 해당된다. 오믹스가 아니라 표현형 중에서도 다양한 표현형 요소들의 패턴을 분석하고자 할 때도 있다.  이런 경우에 활용할 수 있는 방법론이 바로 Clustering analysis(군집분석)와 Factor analysis(요인분석)이다. Clustering analysis먼저 Clustering analysis는 개인별로..

Omics 2024. 3. 11. 23:28

리포프로틴(Lipoprotein)의 정의와 역할 리포프로틴(Lipoprotein)이란, 지질(지방)과 단백질이 결합한 형태입니다. 리포프로틴은 단백질 부분인 아포지단백질(apoprotein)과 지질 부분으로 구성되어 있습니다. 아포지단백질과 지질의 비율과 종류에 따라 여러 가지 리포프로틴으로 분류가 됩니다. 또한 리포프로틴은 주로 혈액 내에서 지질을 운반하는 역할을 합니다. 지질은 물에 녹지 않기 때문에, 지질을 혈액과 같은 수성 환경에서 운반하기 위해서는 리포프로틴의 도움이 필요합니다. 리포프로틴의 종류 콜레스테롤을 운반하는 리포프로틴 저밀도 리포프로틴(Low-Density Lipoprotein, LDL) 종종 "나쁜 콜레스테롤"로 불리는 저밀도 리포프로틴은, 간에서 세포로 콜레스테롤을 운반하는 데 사..

Omics 2024. 3. 6. 12:04

보건학과 건강과학의 기초 이해보건학(Public Health) 또는 건강과학(Health Science)은 인구 집단의 건강을 개선하고, 질병을 예방하는 방법에 초점을 맞춘 학문입니다. 이 분야는 개인의 건강뿐만 아니라, 사회적, 환경적 요인이 건강에 미치는 영향을 폭넓게 다루며, 공공 정책, 건강 교육, 질병 예방 프로그램 개발 등을 통해 공공의 건강을 증진시키는 것을 목표로 합니다. 보건학은 역학, 생물통계학, 환경보건학 등 다양한 분야를 아우르며, 이를 통해 질병의 원인을 규명하고, 건강한 생활 습관을 촉진하는 전략을 개발합니다. 보건학과 건강과학의 정의와 중요성보건학(Public Health) 또는 건강과학(Health Science)이란, 지역 사회의 조직적인 노력으로 건강 수명을 연장하고, 지..

보건학 2024. 2. 25. 13:30